[edit] Ok jeder sollte vergessen was hier stand ich war wohl doch etwas pessimistisch [/edit]

Du hast ja die Formel:
TP = P * M1AInv * M1Akt *Weight1 + P * M2AInv * M2Akt * Weight2 + ...
wobei:
TP ... Transformierter Punkt
P ... ursprünglicher Punkt ohne Bones (Weltkoordinate)
MxAInv ... die invertierte, urspüngliche (Ausgangs-) Matrix von Bone x
MxAkt ... die aktuelle Matrix von Bone x
Weightx ... das Gewicht für Bone x

Dies kannst du nun umformen zu:
TP = P * ( M1AInv * M1Akt *Weight1 + M2AInv * M2Akt * Weight2 + ... )
P = TP * ( M1AInv * M1Akt *Weight1 + M2AInv * M2Akt * Weight2 + ... )^-1

und du solltest deinen Ausgangspunkt haben.

Hab jetzt aber nicht den gesamten Thread gelesen, also möglicherweise wurde das bereits erwähnt ... aber prinzipiell sollte es so hin hauen.

Für das berechnen der aktuellen Matrix brauchst du natürlich ggf. wiederum deine Quaternionen um die Rotation zwischen 2 Keyframes ordentlich zu interpolieren. Wäre sogar möglich, dass Maya hier die Translation der Bones auch nicht linear interpoliert, sondern beispielsweise über Splines. Aber wenn du die Bone-Matrizen zu deinem konkreten Zeitpunkt mal kennst, dann sollte das kein Problem mehr sein.